Причины фарингита в целом просты, как у любого заболевания - вирусная инфекция. Главным бактериальным возбудителем является стрептококковая инфекция группы А, но вместо нее может быть и микоплазма, и стафилоккок, и многие другие, реже встречающиеся бактерии.
Кроме того, к возбудителям заболевания относят грибы и микробы. Спровоцировать фарингит могут и травма слизистой, щелочной или кислотный ожог, аллергические факторы.